Witamy na stronie Katedry Biologii i Biotechnologii Mikroorganizmów

Od 1 października 2019 r. nastąpiła zmiana kierownika i nazwy Katedry.

Zagadnienia badawcze realizowane w katedrze dotyczą następujących aspektów:

• Analizy strukturalnej i taksonomicznej organizmów endofitycznych zasiedlających różne odmiany i gatunki pszenicy ozimej uprawianych w glebie i w warunkach in vitro wraz z określeniem przydatności izolatów do promowania wzrostu i rozwoju pszenicy. Ponadto w ramach tego zagadnienia tworzony będzie biopreparat oparty o endofityczne szczepy mikroorganizmów wyizolowane z różnych odmian pszenicy ozimej a także wytypowane zostaną grupy markerów metabolomicznych charakterystyczne w relacjach troficznych endofit – roślina.
• Rozpoznania wpływu systemu uprawy oraz różnych odmian pszenic na bioróżnorodność mikroorganizmów glebowych obecnych w ryzosferze pszenic.
• Procesu bioremediacji metali przez mikroorganizmy oraz rośliny (paproć wodna Azolla filiculoides L., Azolla caroliniania Willd.) ze szczególnym zwróceniem uwagi na układ endosymbiotyczny roślina-mikroorganizmy, wraz z opisem taksonomicznym i funkcjonalnym rozpoznanych mikrobiomów. Zagadnienie to obejmuje również identyfikację swoistej grupy białek nadających tolerancję wybranych izolatów na metale ciężkie, a także mapowanie metali ciężkich w biomasie izolatów i tkankach rośliny.
• Interdyscyplinarnych badań nad społecznościami mikroorganizmów występującymi w środowiskach glebowych i geologicznych, szczególnie związanych ze złożami węgla brunatnego. Tematyka ta obejmuje analizę aktywności i składu taksonomicznego współczesnej mikroflory oraz rekonstrukcję procesów paleośrodowiskowych w oparciu o biomarkery lipidowe.
• Procesów zachodzących w warunkach zanieczyszczenia środowiska glebowego substancjami ropopochodnymi, ze szczególnym uwzględnieniem wpływu kontaminacji na bilans gazów szklarniowych.
• Mikrobiologicznych przemian metanu w zachodzących w środowiskach ekstremalnie zasolonych wraz z charakterystyką i określeniem potencjału biotechnologicznego wyizolowanych z nich mikroorganizmów.
• Monitoringu fizykochemicznego, biologicznego i taksonomicznego gleb rolniczych
• Oceny stanu ekologicznego zbiorników wodnych stosowanych do hodowli ryb

Współpraca

Wspomniane zagadnienia badawcze realizowane są we współpracy z następującymi jednostkami naukowymi:

• Fundacja Potulicka w Wojnowie
• Instytut Uprawy, Nawożenia i Gleboznawstwa w Puławach
• Hodowla Roślin Strzelce Sp. z o.o. Grupa IHAR
• Lubelski Ośrodek Doradztwa Rolniczego w Końskowoli
• Instytut Agrofizyki PAN w Lublinie 
• Uniwersytet Warszawski (Instytut Geologii)
• State Key Laboratory of Continental Dynamics, Department of Geology, Northwest University, Chiny
• Ivan Franko National University in Lviv, Department of Plant Physiology and Ecology, Ukraina
• Uniwersytet Rolniczy w Krakowie
• Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu

Wyposażenie laboratorium katedry stanowią m. in.:

• analizator form węgla  (TC, TOC i IC) i azotu całkowitego (TN) (TOC-VCSH) (Shimadzu)
• analizator przepływowy form biogennych (AA3, Bran&Luebbe)
• mikroskop fluorescencyjny (Nikon Eclipse 80i)
• spektrometr absorpcji atomowej AAS (ZA3300, Hitachi)
• spektrofotometry UV-VIS (UV-1600, Shimadzu) i UV-VIS-NIR (UV-3600, Shimadzu)
• spektrofotometr NanoDrop (BioSpectrometer, Eppendorf)
• chromatografy gazowe  (GC 8890, Agilent; CP-3800, Varian;  GC2010, Shimadzu)
• chromatograf gazowy sprzężony z detektorem masowym (GCMS-QP2010 Plus, Shimadzu)
• bioreaktory (Biostat A plus, Sartorius)
• chromatograf cieczowy HPLC (Pro-Star, Varian)
• termocyklery (Bio-Rad, Biometria, Sensoquest)
• zestawy do elektroforezy (Bio-Rad, Cleaver)
• aparat do elektroforezy w gradiencie czynnika denaturującego DGGE (Bio-Rad)
• wirówki (Micro 120, Hettich; 3-18R, Sigma)
• koncentrator próżniowy (RVC 2-18, Christ)
• inkubator z wytrząsaniem (Innova 42R, New Brunshiwck Scientiffic)
• inkubatory (Memmert, Hereaus, Termaks, Pol-Eko)
• komory laminarne (Esco)
• komora do pracy w warunkach anaerobowych (Labcomco)
• stacja do produkcji ultraczystej wody (Milli-Q, Millipore)
• mineralizator mikrofalowy (Ethos One, Milestone)