Katedra Historii Kościoła powstała w 2019 roku z połączenia kilku katedr funkcjonujących w ramach ówczesnego Instytutu Historii Kościoła i Patrologii. Celem prowadzonych badań jest przedstawienie dziejów Kościoła od starożytności do czasów najnowszych w różnych aspektach jego oddziaływania w społeczeństwie, na tle historii powszechnej, z uwzględnieniem właściwej mu misji zbawczej. Pracownicy katedry realizują swe prace badawcze i dydaktyczne z uwzględnieniem specjalizacji odpowiadających głównym okresom dziejów: starożytności, średniowieczu, nowożytności i czasom współczesnym. Podejmują też tematykę związaną z uprawianiem historii Kościoła: dzieje teologii, metodologię historii Kościoła, nauki pomocnicze, archiwistykę, dzieje misji katolickich.

Misją Katedry Historii Kościoła jest również praca dydaktyczna zmierzająca do jak najlepszego przygotowania absolwentów do pracy naukowej, dydaktycznej lub duszpasterskiej w strukturach Kościoła katolickiego.